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予果生物:深耕mNGS 实现感染性疾病的精准诊断

2021-11-29 09:35| 发布者: szy9014| 查看: 193| 评论: 0

摘要: 从医生手里的听诊器,到X光检查技术,再到基因检测、宏基因组测序……随着技术的发展,病原诊断的效率和灵敏度逐渐提升。予果生物科技(北京)有限公司创始人&CEO夏涵在接受采访时表示,“如果把传统针对特定病原的 ...
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从医生手里的听诊器,到X光检查技术,再到基因检测、宏基因组测序……随着技术的发展,病原诊断的效率和灵敏度逐渐提升。

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予果生物科技(北京)有限公司创始人&CEO夏涵在接受采访时表示,“如果把传统针对特定病原的检测看成是‘钓鱼’,那么宏基因组二代测序技术(mNGS)就类似于‘大面积撒网捕捞’。mNGS通过对临床样本中直接提取的DNA和/或RNA进行高通量测序,再经过数据库比对与生物信息学分析,可一次完成细菌、真菌、病毒和寄生虫等多种病原体检测,实现感染疾病的精准诊断。”

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今年9月份,予果生物凭借病原微生物高通量基因检测方案从全球84个国家和地区的4018个项目中脱颖而出,荣获HICOOL 2021全球创业大赛一等奖。HICOOL全球创业大赛是以海内外人才创业大赛为主体的综合国际人才活动,大赛打通并建立了海外人才和本土人才来京创新创业的双流通道,今年共有来自84个不同国家的5077名创业者报名参赛,分布在人工智能/金融科技、医药健康、新一代信息技术、新能源/新材料/节能环保、文化创意、高端装备等六大赛道。同时,HICOOL围绕创业项目“发掘-落地-孵化-融资-转化”的普遍生命周期,自2020年起就着力构建大赛/峰会、产业园、管家、基金、在线台、商学院“六位一体”创新创业生态台,在海外创业圈、投资人之间形成了广泛影响力。

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2014年全球病原诊断行业发生了一件划时代的事件,美国UCSF团队使用mNGS,对一位反复发烧患者的体液样本进行基因测序并找到了感染病因,帮医生用最常规的青霉素治愈了这位几乎病危的患者。

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“在这件划时代的事件之后,我们团队就在思考既然mNGS用于病原感染诊断的优势相当明显,如何将宏基因组测序方法更好地标准化,最终应用在市场广阔的病原诊断领域”,夏涵说到。2017年夏涵带领团队创立了予果生物,成为国内最早深耕mNGS的企业之一。

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据了解,予果生物是国内最早将游离核苷酸(cell-free)宏基因组高通量测序技术(mNGS)转化于临床的的企业。其自主研发的PACEseq超高维度机器学模型,能实现对表型缺乏特异、病因不明的患者的鉴别,也可以对不同来源的微生物进行过滤和判断,让病原诊断变得更简单,是当下最具创新的数字化解决方案。

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当人工智能、传感技术、云计算与大数据等技术融入医疗行业,病原诊断方式也发生了升级改变,数字化的诊断方式可以快速鉴别出致病病原体,辅助医生和患者快速明确感染病因,并对症进行治疗。

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夏涵表示,“我们认为下一代的疾病诊断或者未来的疾病诊断应该是基于数字化,因为我们在原来的模拟信号的时代已经停留太长的时间了。”

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夏涵指出,相比于传统诊断模式,数字化诊断最大的差别就是获得的数据量的大小。“宏基因组测序方法不做预先假设,一次检测结果通过与含有2万多种病原的数据库对比就可以获得大量的数据,大量的数据依托先进的算法和AI技术,可以从海量微生物数据中提取并判断病原微生物,进而创造出一种全新的病原诊断模式。”他说到。

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年来,第二代基因测序技术(NGS)引领行业快速发展,并且由于其拥有高通量、低成本、测序时间短等诸多优势,至今NGS在全球测序市场中仍占据主导地位。

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夏涵表示,“在实际临床应用中,宏基因组测序检测的大量样本中发现有些病原是常见的,有些病原是罕见的,但是正因为宏基因组测序可检测出这些常规方法无法检出的病原,医生可参考宏基因组测序检测结果并结合临床表现对症下药,精准治疗,使患者早日康复。”

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随着技术的进步,基因测序市场发展迅速。根据NGS(新一代基因测序)行业峰会数据,我国基因测序产业正步入快车道,2018年全球基因测序市场规模达到102.0亿美元,其中中国基因测序市场规模达到92.0亿元人民,约占全球市场份额的9%-10%。去年我国基因检测企业在一级市场中所获融资达到193亿元,相比2019年融资量,年增长率达153%。

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年来,基因测序行业的迅速发展,吸引了大量资本和企业的涌入。截止2021年中予果生物已经累计完成5.2亿元融资,是mNGS赛道融资体量最大的公司,投资人囊括北极光创投,龙磐资本、辰德资本、创新工场、LYFE等该领域最知名机构。

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夏涵认为,“资本的进入加速了市场的发展,竞争对手的布局也让mNGS领域变得热闹起来。但不管市场是低迷还是热闹,予果会一直坚守‘让病原诊断更简单’这个初心使命,踏踏实实去做创新。”

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将初心化为动力,从72小时,到48小时,再到9小时……4年多来,予果生物在病原精准诊断的速度上一再取得突破。从全国各医院送来的检测样本,已经可以实现当天晚上11点前上机测试,让医生第二天一早便能根据检测结果制定治疗方案。

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前不久,予果生物发布了全新病原检测产品BloodSeq,检测能远比市场常见产品更快速、更灵敏、更精准。该产品一经推出,受到了临床医生的一致好评。

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“我们希望帮助更多的医生进行快速精准的治疗。”夏涵说到。现在,予果生物自主研发的病原数字化检测方案已经在全国31个省份,150多个中心城市开展业务,累计服务超1000家临床医院、2000个临床科室,累计检测样本量10万例,样本总数位居全球前列,其中脑脊液检测量位列全球第一,且增长速度非常快。

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夏涵称,予果生物今年研发投入大约有7000万,明年还会继续加大投入,预测到2024年之前研发投入占比都不会低于30%。予果生物目前能将生信分析和mNGS有效结合,形成较高的技术和数据壁垒。公司未来一段时间仍会专注于研发,做好产品的升级,推动以测序技术做病原诊断市场的发展。

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